預防流腦的最佳策略是對易感人群接種疫苗。目前，我國流腦疫苗接種的保護率可達95%左右。這次流行的新型C群流腦是由C群腦膜炎雙球菌傳播的，與過去常見的A群流腦相比更具傳染性。由于用A群流腦疫苗對C群流腦進行預防的效果較差，因此，易感人群最好使用A+C群流腦多糖疫苗進行預防接種。此外，在流腦流行期間應避免大型集會和集體活動，多吃點大蒜，外出時最好戴口罩，不要帶兒童去公共場所。經常開窗通風、勤曬衣被，也是預防流腦的有效方法。對于體質較弱的易感人群，也可用0.3%的呋喃西林滴鼻，或在短期內口服磺胺類抗菌藥，或用青藍湯（大青葉、板藍根各20克，甘草10克煮湯）進行預防。

需要指出的是，以下人群不適合接種流腦疫苗：

①有中樞神經系統感染者；

②有高熱驚厥史者；

③有嚴重心臟病、肝病、腎臟病，尤其伴有臟器功能不全者；

④精神病患者；

⑤有藥物過敏史或食物過敏史者；

⑥正處于疾病的急性期者。