潛伏期一般為1～5日，也有短至12小時，長至2周。

皮膚炭疽 約占98%，病變多見于面、頸、肩、手和腳等裸露部位皮膚。初為斑疹或丘疹，次日出現水皰，內含淡黃色液體，周圍組織硬而腫脹。第3～4日中心呈現出血性壞死稍下陷，四周有成群小水泡，水腫區繼續擴大。第5～7日壞死區潰破成淺潰瘍，血樣滲出物結成硬而黑似炭塊狀焦痂，痂下有肉芽組織生成(即炭疽癰)。焦痂壞死區直徑大小有等，其周圍皮膚浸潤及水腫范圍較大。由于局部末梢神經受壓而疼痛不著，稍有癢感，無膿腫形成，這是炭疽的特點。以后隨水腫消退，黑痂在1～2周內脫落，逐漸愈合成疤。起病時出現發熱(38～39℃)頭痛、關節痛、周身不適以及局部淋巴結和脾腫大等。

少數病例局部無黑痂形成而呈大塊狀水腫(即惡性水腫)，其擴展迅速，可致大片壞死，多見于眼瞼、頸、大腿及手等組織疏松處。全身癥狀嚴重，若貽誤治療，預后不良。

肺炭疽 多為原發性，也可繼發于皮膚炭疽。可急性起病，輕者有胸悶、胸痛、全身不適、發熱、咳嗽、咯粘液痰帶血。重者以寒戰、高熱起病，由于縱膈淋巴結腫大、出血并壓迫支氣管造成呼吸窘迫、氣急喘鳴、咳嗽、紫紺、血樣痰等。肺部僅可聞及散在的細小濕羅音或有胸膜炎體征。肺部體征與病情常不相符。X線見縱膈增寬、胸水及肺部炎癥。

腸炭疽 可表現為急性腸炎型或急腹癥型。急性腸炎型潛伏期12～18小時。同食者相繼發病，似食物中毒。癥狀輕重不一，發病時突然惡心嘔吐、腹痛、腹瀉。急腹癥型患者全身中毒癥狀嚴重，持續性嘔吐及腹瀉，排血水樣便，腹脹、腹痛，有壓痛或呈腹膜炎征象，常并發敗血癥和感染性休克。如不及時治療常可導致死亡。

腦膜炭疽(炭疽性腦膜炎) 多為繼發性。起病急驟，有劇烈頭痛、嘔吐、昏迷、抽搐，明顯腦膜刺激癥狀，腦脊液多呈血性，少數為黃色，壓力增高，細胞數增多。病情發展迅猛，常因誤診得不到及時治療而死亡。