病人應予胃腸道隔離，除一般治療外，可根據大便細菌培養及藥物敏感試驗選用適當的抗菌藥物作病原治療。如復方磺胺甲基異唑、氯霉素、慶大霉素及卡那霉素等。亦可應用氨芐青霉素或氧哌嗪青霉素等治療。中毒性痢疾應予相應的搶救措施，如抗休克、冬眠藥物和脫水藥的應用等。慢性菌痢可采用保留灌腸的方法治療。

1.病原治療（選用氟啶酸、氨芐青霉素、復方新諾明、丁胺卡那霉素等）。

2.中毒型菌痢治療原則：病原治療十回圈衰竭和呼吸衰竭治療。

3.慢性菌痢治療原則：病原治療+對癥支持治療+并存癥治療。

 4.中藥治療。

 5.對癥支持治療。