每到假期，泌尿科門診里的小男生就多了起來，這些小朋友的問題大多是腹股溝疝氣、陰囊水腫、包皮過長或發炎、隱睪癥，及少部分的尿道下裂。另外，也有相當部分的小朋友，是因為懷疑陰莖短小而被帶至門診的。

一般而言，陰莖在胚胎期第三個月就大致成形了，到了第四個月，尿道的通路也完成了。在同一時期，包皮也開始形成，而這種過程就一直延續到出生后。陰莖的結構是由神經、血管、纖維組織以及三個平行的圓柱形海綿體所組成。可能和有些人想象相反的，陰莖本身是沒有骨骼的，而且肌肉組織也很少；但在陰莖基部的外部，則圍繞了許多肌肉，有助于勃起，射精及排尿。

外表所看到的陰莖，其實是占整支陰莖的一半，另一半則深入骨盆腔的底部，稱為根部，經由結締組織而與恥骨緊密接合，維持陰莖的固定。在陰莖的前端，稱為龜頭，形如其名，出生時為包皮所覆蓋，部份男孩到成年時，包皮可自行退到龜頭后方，如果無法如此，甚或形成包莖，即龜頭無法自然露出，則要施行包皮環切術，好讓龜頭能見天日。

在陰莖內三柱并行的海綿體中，在上方有兩條平行較粗的稱為陰莖海綿體，是陰莖勃起中扮演主要的角色。海綿體是由許多類似征血管平滑肌構成的腔洞，形狀就如同海綿，當這些海綿體充血時，陰莖就會勃起。在睡眠當中，有所謂眼球活動期，陰莖會因充血而勃起，而在小朋友就有這現象，尤其在天亮時可看到勃起的陰莖，這是一種正常的現象。

在陰莖海綿下方，有一條較細的尿道海綿體，其中就含有尿道。而龜頭即由此海綿體的遠程膨大而形成。所以，陰莖的功能就可分成兩大部分，一是排尿的功能，另一是性的功能。在排尿功能方面，陰莖內的尿道，提供了尿液排出的管道，而排尿的控制則主要在膀胱頸。在性功能方面，陰莖就扮演了兩性溝通的重要管道。

陰莖常見的問題依不同年齡層而有分別，在嬰兒時期，較為父母所擔心的大概就是包皮是否太長，陰莖是否太小等問題。在古埃及人和猶太人，在嬰兒期行割禮。古代猶太地方的男子，因沿襲宗教的習俗在出生八天后，就得將包皮切除。而原始的非洲黑人社會，阿拉伯的回教徒都有切除包皮的習慣，但在古代羅馬、歐洲各國、中國則無此習慣。

目前對包皮的看法，則認為包皮在嬰兒時期有保護龜頭的功能，尤其是尿道口除非有包皮龜頭發炎，或因包皮前端出口太緊，導致排尿困難，尿路感染，甚或阻塞性膀胱及腎臟功能障礙，否則很少建議嬰兒或幼童接受切包皮切除手術。然而，到了青春期前后，如果包皮不能自行褪到龜頭的后方，則包皮切除手術則是需要考慮了。在中年，甚或老年人，如果包皮過長，導致包皮垢清除不易，龜頭，包皮經常有濕疹或發炎，包皮也應該切除。在成年人，包皮切除僅要在局部麻醉下即可施行。