陰莖短小有遺傳因素，陰莖與身體其它器官一樣，其大小及形態(tài)特點要受遺傳基因的控制與影響。

陰莖短小與發(fā)育與營養(yǎng)狀況

一般來說， 成年男性體格健壯，身材高大，其外生殖器包括陰莖、陰囊的發(fā)育也較好，陰莖可能較為粗大，反之則可能小一些，但是值得指出的是，陰莖的大小不會與身高成正比例，常可以見到一些身高不足1、60米的男性， 其陰莖勃起時可以達到18厘米以上。

陰莖短小與肥胖也有一些關系 一些小腹部、恥骨聯(lián)合部、會陰部脂肪豐滿突出的男性，往往陰莖的發(fā)育欠佳，比起正常男性的陰莖會相對短小。的確，與肥大的身體相比，這種短小的陰莖在婚后可能會給性生活帶來一定的困難和不理想。

陰莖短小與其它方面也有關系 如內(nèi)分泌紊亂， 男性激素水平不足，陰睪或陰囊腫脹產(chǎn)生的陰莖回縮等，都可能造成陰莖短小。

目前，我國雖然尚未對小陰莖者在男性中所占的比例做過科學的統(tǒng)計，但從臨床中所遇到的病人和接受手術的人數(shù)來看，有這種生理缺陷的人不在少數(shù)，他們中大多數(shù)婚后的性生活不可能會很滿意，因此他們要求手術治療的心情往往是十分迫切。近年來，國內(nèi)外的整形外科學者對小陰莖的整形做了大量的研究和臨床實踐，其主要目的有兩條，一是延長陰莖，再就是增粗陰莖。