慢性前列腺炎的癥狀五花八門，有些癥狀，如腰痛容易與骨科疾病相混淆；另一些癥狀如直腸墜脹容易與肛腸疾病相混淆；而腹股溝、睪丸不適又容易與陰囊內的病變相混淆。那么，如何診斷慢性前列腺炎，將慢性前列腺炎與其它易混淆的疾病區別開來呢?
　　首先應該了解病史，多數患者在慢性前列腺炎的診斷之前都會有過尿路感染的病史，出現過尿頻、尿痛等尿道炎的癥狀。有些人曾有過慢性前列腺炎的一些癥狀，只是誤診為骨科或者肛腸科疾病而沒有得到診斷。
　　其次要詢問癥狀，雖然有一部分慢性前列腺炎患者僅僅有單一癥狀甚至全無癥狀，但是大多數患者多有兩個，甚至兩個以上的癥狀，可稱之為慢性前列腺炎的癥候群。出現前列腺炎癥候群的患者，應注意認真給予檢查，即使一次或某項檢查陰性，也不能輕易除外該病。然后要進行直腸指檢，醫生用手指伸進患者的肛門內檢查。發現前列腺表面不平，質硬，有局限性壓痛提示前列腺炎癥；醫生同時做前列腺按摩，按出的前列腺液中白細胞數目超過每個高倍視野15個有診斷價值。在這里有兩點需要特別強調指出的：
　　1、非專科醫生因種種原因往往不做肛檢，僅憑患者的主觀癥狀就輕率診斷慢性前列腺炎，這是非常有害的，不但使不少并非本病的患者長期服藥，造成很大的麻煩和浪費，而且還使他們承受藥物副作用的傷害和精神上的痛苦。
　　2、一次前列腺鏡檢陰性并不能除外慢性前列腺炎，這是因為慢性前列腺炎本來就可以時重時輕，而且在檢查時流出的一、兩滴前列腺液也可能恰好不是炎癥病灶處的分泌液。因此，患者出現慢性前列腺炎癥候群時，最好到泌尿外科專科看病，若一次前列腺液檢查陰性，不妨過一段時間再復查一至兩次，選擇癥狀較重的時候復查可能更有利于診斷。
　　另外，做前列腺液細菌培養，最好做尿液和前列腺液分段定位培養，發現致病細菌生長有診斷意義。同時做藥物敏感試驗有利于選擇抗生素。必要時，還可進行尿路造影、尿道鏡檢查、B超檢查、鋅元素含量測定、血清抗體檢查等，以幫助診斷慢性前列腺炎，并發現梗阻、結石等慢性前列腺炎的誘發因素。
　　總之，如果病人沒有尿路感染和全身癥狀；具有慢性前列腺炎的癥狀；前列腺液檢查白細胞超過每個高倍視野15個；前列腺液培養有致病細菌生長；就可診斷為慢性前列腺炎。符合上述諸條件標準，僅僅沒有癥狀者稱為隱性前列腺炎。