引起月經不調的原因有兩大類：
1、神經內分泌功能失調引起：主要是下后腦--生茶杯 -卵巢軸的功能不穩定或是有缺陷，即月經病。
2、器質病變或藥物等引起：包括生殖器官局部的炎癥、腫瘤及發育異常、營養不良;顱內疾患;其他內分泌功能失調如甲狀腺、腎上腺皮持功能異常、糖尿病、席漢氏病等;肝臟疾患;血液疾患等。使用治療精神病的藥物;內分泌制劑或采取宮內節育器避孕者均可能發生月經不調。某些職業如長跑運動員容易出現閉經。此外，某些妊娠期異常出血也往往被誤認為是月經不調。
臨床上診斷神經內分泌功能失調性的月經病，必須要排除上述的各種器質性原因。
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