自磺胺及抗生素應用后，沙眼治療上有了顯著進行。實驗研究證明，利福平、四環素、金霉素、土霉素、紅霉素、磺胺及氯霉素等對沙眼衣原體有抑制作用。

1、局部用藥

0.1%利福平或0.5%金霉素或四環素眼藥水每日滴眼3～6次，效果較好。但此類藥物水溶后，數周即逐漸失效，需重新配制。若制成眼藥膏或混懸液可保存較久。10%～30%磺胺醋酰鈉和0.25%～0.5%氯霉素眼藥水易于保存，效果亦佳。前述各藥一般需持續用藥1～3個月。亦可行間歇療法即用藥3～5日后，停藥2～4周，再行用藥，效果亦佳，易于堅持，對于大部分結瘢而仍有殘余乳頭增生“小島”者，可以硫酸銅筆腐蝕，促進結瘢。

2、全身治療

急性期或嚴重的沙眼，除局部滴用藥物外，成人可口服磺胺制劑等。連續服用7～10天為一療程，停藥1周，可再服用。需2～4個療程，應注意藥物的副作用。

3、手術治療

乳頭增生嚴重的，可行藥物摩擦，以棉簽或海螵蛸棒蘸蛸棒蘸磺胺或四環素，摩擦瞼結膜及穹隆結膜。濾泡多者行壓榨術，局麻下以輪狀鑷子擠破濾泡，排出其內容，同時合并藥物治療，促進痊愈。對消眼的后遺癥如少數倒睫可行電解術，瞼內翻倒睫者，需作手術矯正。