肺泡蛋白沉著癥的輕癥者可延緩治療時間，但必須密切觀察，有明顯咯血或呼吸困難的患者通常在結合臨床表現及血常規檢查、血生化檢查、X線表現、痰液檢查、胸部CT檢查等措施確定患者病程及現狀，然后根據患者的病情治療方法有如下幾種：

一、藥物治療

輕癥患者可根據病情遵醫囑服用碘化鉀，主要是溶解粘液；用霧化治療也可以，都是促進吸收。但是這兩種方法的弊端就是見效慢。

二、全肺灌洗

這是肺泡蛋白沉著癥的首選治療方法，當患者感到稍微運動就呼吸不暢時，此方法可以及時改善患者的呼吸困難、降低肺泡內巨噬細胞的活躍度。

全肺灌洗時，患者要進行全身麻醉，對于醫生來說需要有一定的經驗才行。

三、經纖維支氣管鏡分段支氣管肺泡灌洗

選擇這種方法灌洗比較安全，效果也不錯，只是在操作時要特別注意無菌操作，過程中可以鼓勵患者將液體咳出體外，灌洗液一般是無菌鹽水。

四、基因治療

有資料顯示肺泡擔保沉著癥可能跟基因有某種聯系，因此有專家曾在動物身上實驗，發現基因治療有望成功，但要投入臨床還有待時日。

每個患肺泡蛋白沉著癥的人的臨床表現不一，所以治療方法也不一樣，臨床上主要還是以減少患者明顯癥狀為主，患者在治療后要注意提高免疫力，臥床休息。由于肺泡蛋白沉著癥的部分患者在全肺灌洗后還可以再次復發，作為家屬就需要多加關心患者平時的健康狀況和心理變化。