急性肺膿腫的感染細菌，為一般上呼吸道、口腔的常存菌。其中最常見的病原菌為葡萄球菌、鏈球菌、肺炎球菌、梭形菌和螺旋體等。肺膿腫的發病原理與病因有密切關系，可分以下幾種。

(一)吸入性肺膿腫　病原體經口、鼻咽腔吸入，為肺膿腫發病的最主要原因。扁桃體炎、鼻竇炎、齒槽膿溢或齡齒等膿性分泌物;口腔、鼻、咽部手術后的血塊;齒垢或嘔吐物等，在神志昏迷，全身麻醉等情況下，經氣管被吸入肺內，造成細支氣管阻塞，病原菌即可繁殖致病。此外，有一些患者未能發現明顯誘因，國內和國外報告的病例分別為29.3%和23%。可能由于受寒、極度疲勞等誘因的影響，全身免疫狀態與呼吸道防御功能減低，在深睡時吸入口腔的污染分泌物而發病。本型常為單發型。其發生與解剖結構及體位有關。由于右總支氣管較徒直，且管徑較粗，吸入性分泌物易吸入右肺，故右肺發病多于左肺。在仰臥時，好發于上葉后段或下葉背段;在坐位時，好發于下葉后基底段。右側位時，好發于右上葉前段和后段形成的腋亞段。

(二)血源性肺膿腫　皮膚創傷、感染、癤癰、骨髓炎、產后盆腔感染、亞急性細菌性心內膜炎等所致的敗血癥和膿毒血癥，病原菌(多數為金葡菌)、膿毒栓子，經小循環帶至肺，引起小血管栓塞、肺組織發炎和壞死，形成膿腫。病變常為多發性，無一定分布，常發生于兩肺的邊緣部。

(三)繼發性肺膿腫　多繼發于其他疾病，如金黃色葡萄球菌和肺炎桿菌性肺炎、空洞性肺結核、支氣管擴張、支氣管囊腫和支氣管癌等繼發感染，可引起肺膿腫。肺部鄰近器官化膿性病變或外傷感染、膈下膿腫、腎周圍膿腫、脊柱旁膿腫、食管穿孔等，穿破至肺亦可形成膿腫。

(四)阿米巴肺膿腫　多繼發于阿米巴肝膿腫。由于肝膿腫好發于肝右葉的頂部，易穿破膈肌至右肺下葉，形成阿米巴肺膿腫。

早期細支氣管阻塞，肺組織發炎，小血管栓塞，肺組織化膿、壞死，終至形成膿腫。病變可向周圍擴展，甚至超越葉間裂侵犯鄰接的肺段。菌栓使局部組織缺血，助長厭氧菌感染，加重組織壞死。液化的膿液，積聚在膿腔內引起張力增高，最后破潰到支氣管內，咳出大量膿痰。若空氣進入膿腔，膿腫內出現液平面。有時炎癥向周圍肺組織擴展，可形成一致數個膿腔。若膿腫靠近胸膜，可發生局限性纖維蛋白性胸膜炎，引起胸膜粘連。位于肺臟邊緣部的張力性膿腫，若破潰到胸膜腔，則可形成膿氣胸。若支氣管引流下暢，壞死組織殘留在膿腔內，炎癥持續存在，則轉為慢性肺膿腫。膿腔周圍纖維組織增生，膿腔壁增厚，周圍的細支氣管受累，致變形或擴張。