葵花籽含油量高，且這些油脂大多屬于不飽和脂肪酸，進食過多不但會消耗體內的膽堿，使體內脂肪代謝失調，脂肪沉積于肝臟，將會影響肝細胞的正常功能，造成肝功能障礙，還容易引起結締組織增生，甚至誘發肝組織壞死或肝硬化。

有些葵花籽在炒制時的香料，如桂皮、大茴、花椒等對胃都有一定的刺激作用，尤其是桂皮中含一種黃樟素的物質，動物實驗證實其有致癌作用。老年人肝臟解毒功能下降，吃得太多，肝臟負擔加重。

葵花籽在加工過程中，需要大量的食鹽，而水、鹽是一對孿生姐妹，鹽攝取過多，可使水在血管內潴留，使血管阻力增加，血壓升高或使高血壓癥狀加劇，嚴重者還會誘發腦中風或心絞痛。