急型克山病的病死率高，約30％～85％，自應用大劑量維生素C搶救克山病心源性休克，亞硒酸鈉預防克山病急性發作以來，發病率和病死率已降至歷史最低水平，病死率已降至6％～18.9％。如能早期、及時、合理治療和搶救，臨床治愈率可達85％以上。有20％可轉為慢型，20％左右轉為潛在型，癥狀可完全消除。如不及時積極治療，可在發病后24小時內死亡，約50％在2天內死亡，多為心源性休克或猝死。
亞急型和慢型患者心臟明顯擴大，可急性發作，亦可猝死。有部分患者轉為潛在型。大部分患者不能參加重體力勞動。
潛在型可保持一定的勞動力，病程中可出現急性發作，也可漸轉成慢型克山病，有嚴重心律失常者預后不佳。