心外科微創手術力求在矯治心臟畸形的同時減少手術所造成的創傷。廣義的心外科微創手術的類型包括非傳統路徑進胸、胸腔鏡輔助外科治療、免開胸體外循環、心臟不停跳及非體外循環手術(不包括介入治療)。

右外側小切口、胸前正中小切口

應用傳統體外循環技術，為維持胸廓完整性或避免正中劈胸骨切口，分別采取胸前正中小切口、腋下小切口和右外側小切口開胸，起到減輕手術創傷和切口美容的效果，目前應用最多。

非體外循環下某些復雜先心的糾治手術

盡管體外循環安全性有了很大提高，但是非生理界面所致的炎性反應使肺阻力明顯增高，右心旁路手術受影響更大。因此，可利用上腔或下腔靜脈右房轉流技術，在非體外循環下進行雙向格林手術以及全腔靜脈與肺動脈吻合術。

不停跳心內直視手術

隨著“溫暖心臟外科”概念的提出，不停跳心內直視手術的應用愈來愈多。因為不停跳手術中，心臟始終處于氧合血灌注，術后低心排血量的發生率低。目前可進行房缺修補、肺動脈狹窄糾治，二尖瓣、主動脈瓣的置換等。

電視胸腔鏡下矯治心臟疾病

目前，經小切口或洞孔進行操作，通過電視胸腔鏡矯治心血管疾病的應用越來越多。除常見的動脈導管未閉。房缺、室缺外，一些稍復雜的先心病也有在胸腔鏡下矯治成功的報道，目前胸腔鏡下行血管采集及冠脈搭橋手術的應用越來越多。

微創外科與介入治療相結合

外科手術聯合介入治療技術，較常規手術創傷小，較經皮導管封堵法治療手術費用低，且無X線照射，無需注射造影劑，擴大了介入治療的范圍，如微切口下房缺封堵術。