結石：男性尿道結石是常見疾病，當小的結石嵌在后尿道，尤其嵌在射精管的開口部位，射精時這些部位收縮和蠕動，擠壓結石而產生疼痛。如前列腺或精囊有結石，射精時這些部位收縮也會產生疼痛。

生殖器官炎癥：男性下尿路感染是導致射精疼痛最常見的原因。患有膀胱炎、尿道炎、前列腺炎，射精時，這些器官的肌肉發生節律性收縮，對炎癥病灶是一種機械刺激，以致引起劇烈疼痛。有的患者還會發生疼痛性遺精。

腫瘤：男性泌尿生殖器官的惡性腫瘤，大多會引起射精疼痛。如睪丸、附睪、前列腺等處發生腫瘤時，壓迫或阻塞射精管道，射精時會發生疼痛。不過，其疼痛性質較為緩和，多是隱痛和酸痛。精囊，輸精管等處發生腫瘤的機會雖然不多，但病變的進展多為隱匿性。因此，這種疼痛應引起重視。

其他疾病：患有陰莖硬結癥的人，房事時陰莖勃起會疼痛，射精時加重。患尿道狹窄的人，*排出不暢，尿道企圖強行擠出*，也會引起疼痛。此外，男性泌尿系結核，尿道息肉等亦會造成射精疼痛。

射精痛的處理應該先查明造成射精痛的原因，針對病因來確定是不是要治療?應該怎樣治療?比如：是由包莖引起的，則必須做的手術，否則不僅影響性生活也會影響生育功能;如果是由泌尿系統的炎癥、結石、腫瘤引起的，就要立即治療。