大部分患者因為不知道性功能障礙如何治療，可能會導致病情進一步進展，進而影響到患者的生活。建議患者不用過于擔心，通常可以通過性行為治療、藥物治療、心理治療等方式進行治療。
1.性行為治療：對于性功能障礙的患者，一般都應該進行性教育，以矯正他們對性的錯誤認識。同時，患者也可以重點鍛煉自己的身體性，這樣能夠更好的熟悉性交的過程，并能夠更好的適應這個過程，不但能夠增加對性生活的反應，還能夠更好的享受性生活的快樂與快感，還能夠減少性交的焦慮。
2.藥物治療：性功能障礙患者出現射精控制能力不佳、早泄等情況時，患者可以按照醫囑吃枸櫞酸西地那非片、他達拉非片、鹽酸達泊西汀片等藥物進行治療，通常可以改善局部供血，延緩局部神經傳導，減少勃起功能障礙或者早泄的困擾。
3.心理治療：患者也要做好心理治療，一般的性功能障礙患者都會出現不同程度的焦慮和抑郁情緒，缺乏關于性生活的相關知識，通過醫生與患者的溝通，可以知道患者發生性生活困難的原因，然后給患者提供一些生活方式方面的指導。患者可以通過厭惡療法、精神分析法等方式，有效緩解性功能障礙。
患者在知道性功能障礙如何治療后，還應保持一個良好的情緒。