急性腎盂腎炎治療時宜盡早控制感染，卻除誘發腎盂腎炎的不良因素和對癥處理。

(1)控制感染 及時選用適當的抗生素，不要等待尿培養結果和藥敏試驗回報，以免貽誤病情。一般首選對革蘭氏染色陰性桿菌敏感的抗生素，因為80%的腎盂腎炎是由此類細菌引起。或以尿沉渣涂片，革蘭氏染色后選擇抗生素。以抗生素的抗菌譜較寬的為好。且所選用的藥物在血中、尿中都有較高濃度，腎毒性低。用藥72小時無效時(癥狀不減輕或尿檢無好轉)方換其他抗生素，不宜頻繁換藥。

要用夠療程，一般為10—14天，或癥狀緩解后繼用藥3—5天。停藥后宜隨訪觀察，每周復查一次尿常規及尿細菌培養，6周后無膿尿及茵尿方可認為痊愈。如果療程短，治療不徹底，或停藥后不復查，有可能復發或轉為慢性，故用藥足療程和隨訪非常重要。

(2)卻除易惑因素 如用抗生素正規治療癥狀得不到改善，膿尿或菌尿不消失，應積極尋找并治療誘發腎盂腎炎的因素——易感因素。如解決尿路梗阻，治療慢性病，糾正代謝紊亂等。

 (3)對癥處理 臥床休息和高熱量、高維生素飲食有助于機體恢復，重要的是給予足夠的水分沖洗尿路，鼓勵多飲水以保持足夠的尿量。對尿急、尿頻、尿痛癥狀明顯者，可給予顛茄、阿托品等解疼劑或采取針刺療法(取足三里、關元、中極或三陰交等穴)，以緩解尿痛及排尿困難。服碳酸氫鈉堿化尿液，也有助于緩解尿痛等尿路不適。