內分泌系統在更年期的變化比較顯著，其中最重要的是性腺。男性最大的性腺器官，就是睪丸。睪丸組織自30～50歲以后就逐漸有退行性改變，表現為曲細精管基底膜增厚，部分曲細精管閉塞，透明樣變，精子數量減少等。但產生雄激素的間質細胞則位于曲細精管之外，其變化則不完全與曲細精管改變同步，其功能衰退較女性緩慢。雖然隨著年齡的增高，睪丸可萎縮、變軟，睪酮的分泌盡管有所下降，但較平緩，從而使性腺與下丘腦，垂體之間的關系有較為充分的重新調整機會。故男性更年期因性腺與內分泌功能失調致嚴重癥狀者較少，此為其原因之一。

　　此外，人至中年后期，甲狀腺、腎上腺以及胰島、胸腺等內分泌功能也都有不同程度的改變，但一般說來，與維持生命有關的促腎上腺皮質激素、腎上腺皮質激素的變化不大，而三碘甲狀腺原氨酸(T3)、游離T3、有活性腎素則隨增齡而有緩慢減少趨勢。中年人血中生長激素(GH)的基礎水平與年輕人相比雖無明顯改變，但年輕人在深睡時正常出現的GH釋放峰至中年以后則不再出現，而且GH對精氨酸或胰島素引起的低血糖反應減弱。以上證據足以說明，隨著增齡，GH的釋放和活力亦在逐步下降。