子宮肌瘤的發病原因可從組織發生來看，早就有子宮肌瘤細胞源于子宮肌、血管壁的平滑肌細胞如未成熟的成肌細胞，但后者在組織學上尚未明確概念。組織學研究發現生長時間不長的微小子宮肌瘤，不但有富含肌絲的成熟平滑肌細胞，而且也發現在胎兒子宮見到的未成熟平滑肌細胞。表明人類子宮肌瘤的發生可能來自未分化間葉細胞向平滑肌細胞的分化過程。

子宮肌瘤的發病原因從多發性子宮肌瘤來看可能是由于起源細胞在子宮肌層內多灶潛伏。它具有生物學媒體，依賴雌激素增殖，靠孕酮分化、肥大。進入性成熟期后，殘存于肌層的未分化間葉細胞和未成熟的平滑肌細胞，在雌、孕激素周期作用下出現自身連續性增殖、分化及肥大過程，在長時間內反復進行，直至形成肌瘤。以上就是子宮肌瘤的發病原因。

雖然研究表明，目前的子宮肌瘤原因還尚不明確所猜想的原因也未被證實，但是跟雌激素有關是毋庸置疑的。因為有了雌激素的長期刺激導致了女性體內的病毒病變。尤其是在高雌激素環境中，如妊娠、外源性高雌激素等情況下子宮肌瘤生長尤為明顯，而絕經后的肌瘤沒有雌性激素所依賴又逐漸縮小。