性交疼痛：

異位的子宮內膜使周圍組織腫脹，當性交時由于受陰莖抽動的影響，引起疼痛，以月經前期較為明顯。

子宮增大：

子宮內膜可以“移位”到子宮肌壁內，使子宮增大，每當月經來潮時，子宮肌壁間的內膜也受激素的影響，發生出血，引起疼痛，非常痛苦。

卵巢腫瘤：

卵巢是異位的子宮內膜最愛“居住”的場所，每當月經來潮，經血總會在卵巢存留，而且會越存越多，慢慢地包塊就不知不覺地形成了，隨著月經周期的變化，包塊可以時大時小，包塊里面存積的血液漸漸增加，由于存積的血液日久變質，紅細胞被破壞，故當切開包塊時，所見的內容物酷似巧克力，這在醫學上稱為“巧克力囊腫”。

異位的子宮內膜有與正常子宮內膜相同的腺體和間質，但因它有很強的細胞增殖、浸潤和復發性，其病變廣泛、形態多樣，臨床表現與惡性腫瘤頗為相似，因此臨床上也常稱之為“良性癌”，成為難治之癥。由于尚不清楚其發病機制，所以治療效果亦不理想。