1、不孕：約有50%左右內異癥患者伴有不孕，在不明原因不孕患者中，約30-40%患內異癥。內異癥患有不孕，常因病變造成盆腔腫塊、粘連、輸卵管堵塞卵泡發育不好或排卵障礙等因素引起;而一旦懷孕則異位內膜受到抑制而萎縮，對內異癥起到很好的治療，習慣性流產病例中有部分為子宮內膜異位癥所致。

　　2、痛經：內異癥的臨床特征為漸進性痛經，是常見而突出的特征，多為繼發性，即自發生內膜異位開始，患者訴說以往月經來潮時并無疼痛，而從某一個時期開始出現痛經，可發生在月經前、月經時及月經后。有的痛經較重難忍，需要臥床休息或用藥止痛，甚至痛得“滾炕”或撞頭，疼痛常隨著月經周期而加重，月經結束而消失，但國內報道有21%約無痛經。

　　3、周期性直腸刺激癥狀：進行性加劇的周期性直腸刺激癥狀罕見于其他婦科疾病，是診斷本癥最有價值的癥侯。直腸、肛門、外陰部墜脹、墜痛、里急后重感和大便次數增多。當病變逐漸加重時，癥狀日趨明顯，而經后癥狀消失。

　　4、月經不調：內異癥患者常有月經周期縮短、經量增多或經期延長等現象，說明患者有卵巢功能障礙表現。月經不調可作診斷參考，但在鑒別診斷中并無價值。

　　5、性交痛：當存在于陰道穹窿部異位子宮內膜結節、直腸凹陷結節或粘連，或卵巢粘連在盆底時，均可產生性交痛。闊韌帶后葉病灶纖維化增生及收縮明顯時，可以外源性壓迫輸尿管，使其狹窄阻塞，亦可能出現泌尿系統癥狀，嚴重的可發生輸尿管積水或腎盂積水。

　　6、周期性膀胱刺激癥狀：當內異癥病變累及膀胱腹膜反褶或侵犯膀胱肌層時，會同時出現經期尿急、尿頻等癥狀。若病變侵犯膀胱粘膜(膀胱子宮內膜異位癥)則有周期性血尿和疼痛。

　　7、經期或行經前后的急腹癥：一般為卵巢子宮內膜囊腫，有穿破的特點，多數患者因卵巢囊腫扭轉或宮外孕而急診手術。若不手術而好轉時，盆腔粘連加重，今后還會反復破裂發生急腹癥。

　　8、周期性下腹不適：本癥狀的出現率高于痛經，無痛經的內異癥患者常存在于本癥狀。出現于輕癥患者，或某些病變雖較重但由于痛閾的個性差異或其他原因，不產生痛經癥狀而僅有經期腰酸、下腹墜脹不適感。

　　9、腹壁疤痕及臍部的子宮內膜異位癥則出現周期性局部腫塊及疼痛。

　　10、內在型子宮內膜異位癥患者往往子宮脹大，但很少超過3個月妊娠。如為后位子宮，往往粘連固定。

　　11、在子宮直腸窩、子宮骶韌帶或宮頸后壁常可觸及1-2個或更多硬性小結節，如綠豆或黃豆大小，多有明顯的觸痛，肛診更為明顯，這點很重要。卵巢囊腫可長至拳大，由于常有囊腫內容物外溢和異位內膜出血，盆腔臟器粘連加重成冰凍盆腔狀，即是所謂廣泛內異癥。病變程度輕重不同時體征差別很大。

　　12、B超聲象圖：B超顯象是目前輔助診斷子宮內膜異位癥的有效方法，主要用以觀察卵巢子宮內膜異位囊腫，其聲象圖的特征為：

　　(1)囊性腫塊，邊界清晰或不清。如囊腫周圍粘連重，則邊界不清;如囊腫與子宮或周圍組織粘連少，則邊界清晰。囊腫多為中等大小，囊腫內可見顆粒狀細小回聲，是囊液粘稠表現。有時因陳舊性血塊濃縮機化而出現較密集的粗光點圖象，呈混合性腫塊狀。

　　(2)腫塊常位于子宮后側，可見囊腫子宮伴隨癥。

　　(3)囊腫自發破裂時，聲象圖示后凹陷，囊腫較前縮小。

　　(4)腹腔鏡檢查：腹腔鏡檢查是目前診斷子宮內膜異位癥的新標準，通過腹腔鏡可直接窺視盆腔，見到異位病灶即可明確診斷，且可進行臨床分期，以決定治療方案。