尖銳濕疣的鑒別診斷十分重要，一旦有誤診對患者造成很大的精神傷害。尖銳濕疣常需與生殖器癌、扁平濕疣、假性濕疣、生殖器鮑溫樣丘疹病及珍珠樣丘疹病鑒別。

(1)生殖器癌區分不清，癌有明顯的浸潤，常形成潰瘍，有時應進行病理組織學檢查。

(2)扁平濕疣為梅毒二期皮疹扁平濕疣基底寬，無蒂，外觀扁平，疣面潮濕、光滑。暗視野顯微鏡檢查可找到梅毒螺旋體，梅毒血清反應為陽性。

(3)假性濕疣又稱女性絨毛狀小陰唇，在女性的小陰唇上出現魚卵狀、排列規則的增生物。

(4)珍珠樣丘疹病發生于男性的龜頭，沿龜頭冠狀溝有排列整齊的大小一致的珍珠樣丘疹。本病病因不明，常見于青年男性。

預防尖銳濕疣要注意以下幾方面：

(1)堅決防止亂性，患病后禁止性生活

(2)講究個人衛生，防止接觸傳染

(3)患病后或者有可疑癥狀，應該及時選擇正規醫院進行科學有效的治療，以免反復難愈和并發它癥或者癌變的發生。

(4)若治療后半年不復發，則基本確定已治愈。因此，在半年之內，一定要堅持復診。