本病病原體為肉芽腫莢膜桿菌，是一個細胞內微生物，革蘭氏陰性短桿狀細菌，近年有人認為本菌是一種裂殖菌，存在于肉芽組織中的單核細胞內外，在空胞中組成巨噬細胞，大小為0.6μm×1.5μm，此細菌的組織球，有時因多核白血球、巨噬細胞增殖在細胞內的空泡中可集聚20-30個之多，向細胞放出，故又稱Donovan小體。肉芽腫莢膜桿菌在人工培養基中培養難以成功，其生物學性狀基本不明，但有人將該菌接種在含孵雞卵黃培養基中培養成功，但將培養出的病原體再給人接種，并未發生象腹股溝肉芽種樣病變。由于人工培養基培養不能成功，細菌學檢查極為困難。用血清學檢查也不易證明。鏡檢：從病灶部取一小塊病變組織，制成涂抹干燥待檢標本，用姬姆薩染色、瑞氏染色。鏡檢倍數10×100倍油浸觀察，肉芽腫莢膜桿菌為大型的組織球集聚在原生質內形成Donovan小體，并呈藍黑色。雖經卵黃囊內接種取得成功，證明無運動性，革蘭氏陰性，但在臨床上很少有實用價值。病理組織活檢;從肉芽組織邊緣深部取材，活檢程序用姬姆薩染色，可見藍黑色的Donovan小體，電鏡下同樣可見其小體。