血尿95%以上是由于泌尿系本身疾病所致，其中以腎小球疾病（急性腎炎、急進性腎炎、膜增殖性腎炎、系膜增生性腎炎、局灶性腎小球硬化癥等）、腎囊腫、結石（腎、輸尿管、膀胱、尿道結石）、前列腺增生、尿路感染性疾病（結核、腎盂腎炎、膀胱尿道炎、前列腺炎）及腫瘤（腎、輸尿管、膀胱、前列腺腫瘤）最為多見。其他如凝血異常的疾病（特發性或藥物性血小板減少、血友病、壞血病等）、全身性疾病（再障、白血病、系統性紅斑狼瘡、皮肌炎、鉤端螺旋體病、流行性出血熱等）也可引起血尿。
1、腎結核血尿：早期僅在尿中查到紅細胞和膿細胞，隨后出現尿頻、尿急、尿痛和終末血尿，患者常有以往的結核史。
2、前列腺增生血尿：少數病人膀胱鏡粘膜破裂血管出血引起的肉眼血尿，有時排血塊。尿頻是早期癥狀
3、泌尿系結石血尿：膀胱尿道結石有排尿困難、排尿費力和血尿，腎、輸尿管結石出現腎絞痛，如合并感染則可出現發燒、寒戰等。
4、泌尿系腫瘤引起血尿腎盂腫瘤常有血尿，腎癌血尿見于50～60%病例。就診時1/4腎腫瘤病例已屬晚期。血尿特點：無痛、間歇性全程血尿，有時可觸及腹部胂塊，伴有消瘦發熱等。膀胱癌血尿：占泌尿系統中腫瘤第一位，血尿見于90%病例肉眼血尿占50%，血尿特點：無痛性全程血尿，有時伴終末血尿加重，呈間歇性發生在間歇中易給病人已治愈的錯覺，做膀胱鏡檢查即可診斷。
5、腎下垂血尿：主要癥狀腰痛、勞動及行走加劇，平臥后消失。尿內常出現程度不同的血尿，往往合并有腎積水。