就治療疾病來說，都有其最好的治療方法，肛瘺同樣是如此，但是需要注意的是，并不是越先進的技術就是越好的治療方式，其要根據患者的病情進行治療，就以手術來說，其盡管先進，但是如果是肛瘺初期，其在治療上，沒有必要選擇手術治療，因此其不是最好的治療方式，下面，就治療肛瘺的方法總結如下：

1、瘺管切開術。是將瘺管全部切開開放，靠肉芽組織生長使傷口愈合的方法。適用于低位肛瘺，因瘺管在外括約肌深部以下。切刀開后只損傷外括約肌皮下部和淺部，不會出現術后肛門失禁。

2、肛瘺切除術。切開瘺管并將瘺骨壁全部切除至健康組織，創面不于縫合;若創面較大，可部分縫合，部分敞開，填人油紗布，使創而由底向外生長至愈合。適用于低位單純性肛瘺。

3、掛線療法。是利用橡皮筋或有腐蝕作用的藥線的機械性壓迫作用，緩慢切開肛瘺的方法。適用于距肛門3-5cm內，有內外口低位或高位單純性肛瘺，或作為復雜性肛瘺切開、切除的輔助治療。

如果是采用手術治療的情況下，術后的護理是關鍵，尤其是手術的部位，術后的手術部位非常容易受到各個方面細菌的侵襲，從而發生感染，導致疾病的引發，這一點對于女性來說，表現的尤其明顯。因此，關于這一點要重視。