綠豆芽其性涼、味甘無毒，能清署熱、調五臟、解諸毒、利尿除濕，可用于飲酒過度、濕熱郁滯、食少體倦。高血壓和冠心病患者，夏季可常食素炒綠豆芽。民間用綠豆芽同鯽魚燉服，治乳汁不下。綠豆芽榨汁，加白糖代茶飲，治尿路感染、小便赤熱、尿頻等癥。

日本科學家發現，在綠豆發芽過程中，部分蛋白質可分解為氨基酸，從而增加原有氨基酸含量。其中還含有纖維素，若與韭菜同炒或涼拌，用于老年及幼兒便秘，既安全又有良效。取食綠豆芽，可治療因缺乏維生素A而引起的夜盲癥、缺乏維生素B2而引起的舌瘡口炎及陰囊炎、缺乏維生素C引起的壞血病等。

烹食綠豆芽時最好加點醋，這樣可使蛋白質盡快凝固，既可保持豆芽體堅挺美觀，又可保存營養；同時應熱鍋快炒，使維生素C免致過多破壞。

此外，綠豆芽所含的能量很低，卻含有豐富的纖維素、維生素和礦物質，有美容排毒、消脂通便、抗氧化的功效。從營養學的角度看，綠豆芽的熱量很低，每100克綠豆芽僅含8卡路熱量，而其所含的豐富的纖維素卻可促進腸蠕動，具有通便的作用，這些特點決定了綠豆芽的減肥作用。