腹針療法針刺的深淺也影響著腹針的治療方向，要認真掌握。腹針腹部穴位分為天、人、地三部，分別對應“淺刺調筋骨、中刺調經脈、深刺調臟腑”。

腹針穴位是一個立體結構，有著一定的空間層次。腹針理論指出，淺刺調筋骨、中刺調經脈、深刺調臟腑。針刺深淺掌握不當，也不能取得預期的療效。比如，上風濕點淺刺，針對“神龜圖”對應的肘關節的“筋骨”，可以治療網球肘、肘部扭傷、肘部風濕痛等等;如若深刺該穴，即是針對肝臟的調節，可以治療肝氣不舒、橫逆犯脾所致的納差、便溏、腹脹腹痛，可以治療肝風內動所致眩暈、血壓升高，可以治療肝不藏血所致月經不調、崩漏等等。雖然嚴格地定位了腹針的腹部穴位，但是，不同的針刺深淺，就針對了不同的疾病類型。所以，要提高薄氏腹針的臨床療效，針刺的深淺也是一個必須注意的因素。

一般而言，天、人、地三部，深度均在脂肪層及在筋膜上，未達肌層，不入腹腔。比如中脘穴，淺刺，針對頭面疾患;中刺，針對胃脘疾患;深刺，則調節心臟功能。需要強調的是，在天、人、地三個層次的每個層次中，還要再細分層次。比如中脘天部淺刺層次當中又淺刺，針對的是前額頭痛，天部淺刺層次當中深刺，針對的是后枕頭痛。臨床應當詳查，對于提高腹針的療效，極有幫助。