偏頭疼的病因目前尚不清楚，但可能與下列因素有關：

(1)遺傳因素，約60%的患者可問出家族史，部分病人家庭中可有癲癇病人，故認為該病與遺傳有關，但尚無一致的遺傳形式。

(2)內分泌因素，血管性偏頭疼多見于青春期女性。更年期后逐漸減輕或消失，月經期發作頻繁，妊娠時發作停止，分娩后再發，表明內分泌因素是導致本病病因之一。

(3)飲食因素，不少患者發作常與飲食有關，如經常食用奶酪、巧克力、刺激性食物、煙酒等均可產生血管性偏頭疼。

(4)其他因素，情緒緊張、精神創傷、憂慮、焦慮、饑餓、失眠、外界環境差以及氣候變化均可誘發偏頭疼發作。