目前，常應用的間充質干細胞為骨髓間充質干細胞、臍帶血間充質干細胞和皮膚間充質干細胞，它們都具有增殖分化潛能高、免疫原性低等特點，但臍帶血間充質干細胞僅在分娩新生兒時進行采集，因此來源受限。而骨髓間充質干細胞的制備過程不容易質控;移植給異體可能引起免疫反應;取材時對患者有損傷，患者有骨髓疾病時不能采集，即使是健康供者，亦不能抽取太多的骨髓，這都限制了骨髓間充質干細胞臨床應用。與此兩類干細胞相比，皮膚間充質干細胞取材方便，并且分離細胞的數量和純度均很高，多次傳代擴增后仍具有干細胞特性，并且不論是自體還是同種異源的間充質干細胞，一般都不會引起宿主的免疫反應。