有75%的男性常常出現早泄，這點被用來說明早泄是“正常的“，但從它的發展來看還是有其生物學基礎的。還有一些人基于某些簡單的關系而認為早泄的原因并不復雜。例如，有人指出早泄是由于性交頻率不足所致，因為許多研究者注意到早泄與性交頻率呈負相關。盡管有證據表明很多原發性或終身性的早泄有不受意識控制的生理學或神經學反射的器質性原因，但也有不同的觀點。有早泄的男性比沒有早泄的男性其球海綿體肌反射(BCR)要快。這一點支持了早泄的男性具有生物學的易感性，導致陰莖更敏感的理論，因此這種情況可能是由于龜頭神經的高度敏感性所致，對脊髓神經中樞過多的刺激最終誘發射精。應用生物震撼閾測量法對120名早泄病人和66名性功能正常的男性自愿者的龜頭、陰莖體、陰囊和示指(作為對照)的敏感性進行測定，通過這項研究我們已證實了早泄具有這種器質性的病變基礎。龜頭、陰莖體的生物震撼閾測量參數表明早泄的病人比正常人的明顯低，這說明早泄是與陰莖的高敏感性密切相關的。其他人研究了皮層激發電位后發現了類似的結果，指出了早泄男性與正常男性之間的不同之處。通過測量陰莖體和龜頭激發電位的潛伏期及振幅，我們測定了34名早泄男性和30名正常男性的皮層軀體感覺的激發電位。早泄病人其支配龜頭的背側神經的平均潛伏期和振幅均比對照組短、小。這說明早泄病人的龜頭有高度的敏感性和興奮性，從而導致無法控制射精。

器質性的原因

已知一些器質性的損傷和疾病會導致早泄，其中包括腹主動脈瘤手術所致交感神經系統的損傷，骨盆骨折，前列腺增生癥和前列腺炎，尿路感染，糖尿病，小動脈硬化，心血管疾病，生殖泌尿系局部的疾病，全身性神經系統疾病和局部感覺器的損傷。其它相對少見的原因包括假性紅細胞增多癥和多神經炎。