陰莖是男子的交媾器官。陰莖體由陰莖海綿體和尿道綿體組成，具有豐富的血管、神經、淋巴管。陰莖冠狀溝處神經分布最豐富，敏感性最高。陰莖冠狀溝一旦接受了性刺激就會通過初級勃起中樞形成完整的神經反射弧，使陰莖隨意不或隨意地勃起，而且能持續相當長的時間，完成性交活動。
古代人將男子陰莖作為"神"的象征，認為陰莖是種族繁衍最重要的器官。現代人將陰莖看作男子"陽剛之氣"的象征。
人的陰莖和身材高矮、胖瘦、五官大小等一樣存在著眾多的差別，長短不一，粗細不齊。國內史成禮曾測定1412例中國健康男性青年的陰莖大小及126例健康男性的陰莖勃起長度。結果表明，常態時最長為14．5厘米，最短4厘米，平均8．375厘米；周長最大12厘米，最小4．5厘米，平均8．3厘米。勃起時最長16厘米，最短9厘米，平均12厘米；勃起時周長最大14厘米，最小8厘米，平均10．75厘米。劉國振等調查的1000例正常成年男子的陰莖長度為：常態下長度范圍為4．9－8．6厘米，平均6．55厘米，最長10．6厘米，最短3．7厘米。吳偉成等對2547例16－40歲男大學生陰莖進行測量，其長度平均值為7．43厘米，周徑平均為8．17厘米；陰莖牽長平均13．34厘米，與計算出的勃起長度13．08厘米相似，故考慮牽長可代表勃起后長度。可見不同作者的測量結果也存在一定的差別，其結果還受地區、民族等影響。此外，在常態下同一個人的陰莖長度也不恒定，如緊張、寒冷或嚴重疲勞時都可使陰莖短縮。
怎樣認定陰莖過小呢？陰莖在青春期前短于2.5厘米，青春期后短于5厘米，而且發育不正常，沒有勃起功能；特別是第二性征發育不良，性功能障礙，無生育力，無精子，這時方可認為是陰莖發育不正常。導致真正小陰莖的病因包括：
(1)病變原發于睪丸的高促性腺激素性腺功能低下癥，這時下丘腦和垂體正常，能發出強有力的指令，但睪丸有病，無法執行生產性激素和精子的命令。
(2)低促性腺激素性腺功能低下癥，這是因為下丘腦和垂體有病變，不能向下發出分泌睪酮指令。
(3)部分性抗雄激素綜合征，即陰莖對雄激素不敏感，患者體內睪酮水平正常，但第二性征異常，甚至可能有尿道下裂。
(4)特發性小陰莖，原因至今不明。
順便提一下，陰莖長度的測量方法很重要，一是測疲軟狀態，二是測勃起狀態時的變化。測量時室溫宜25°Ｃ左右，待心情平靜并適當休息之后，用手把陰莖抬平，用硬尺的一端稍用力頂住恥骨聯合部，盡量壓縮皮下脂肪層，另一端以陰莖龜頭尿道外口為基準，所讀出的數字即為陰莖常態下的長度。再用皮尺在離冠狀緣1厘米的陰莖干部測其周徑。由于病人緊張或不適應診室的環境，他們在醫生面前多不能勃起，故常用陰莖的牽拉長度取代勃起長度。