為了敘述方便，我們把陰莖的發生與發育過程分為四個階段：

　　(1)妊娠第10－12周，陰莖剛剛分化好，只有3.5毫米長，這時起作用的是在胎盤分泌的hCG作用下而產生的睪酮。

　　(2)妊娠的中、后期6個月，陰莖生長速度很快，出生時已達2.5－3.5厘米，這時胎兒垂體開始分泌促性腺激素LH和FSH。

　　(3)出生后至青春期前（7歲左右），陰莖生長緩慢，這是因為下丘腦、垂體發育慢，睪酮水平也低的緣故。

　　(4)青春期開始后，垂體和睪丸激素分泌旺盛，陰莖迅速生長，僅5年左右就達到成人水平，增長增粗。當老年性激素水平顯著降低或外科去勢后，陰莖可繼發性退化。若繼發性陽痿停止性接觸多年之后，也有可能造成病理性退化，這不是一般所說的用進廢退問題，而是平滑肌纖維發生退行性變化的后果。

　　總之，陰莖的分化與發育全靠體內的睪酮水平，如果妊娠第6－9個月期間，睪酮分泌不足，陰莖發育低于正常速度，出生時陰莖便較小。

　　那么，怎樣才算是真正的小陰莖呢？陰莖在青春期前短于2.5厘米，青春期后短于5厘米，而且發育不正常，沒有勃起功能；特別是第二性征發育不良，性功能障礙，無生育力，無精子，這時方可認為是陰莖發育不正常。
　　
　　陰莖長度的測量方法很重要，一是測疲軟狀態，二是測勃起狀態時的變化。測量時室溫宜25°Ｃ左右，待心情平靜并適當休息之后，用手把陰莖抬平，用硬尺的一端稍用力頂住恥骨聯合部，盡量壓縮皮下脂肪層，另一端以陰莖龜頭尿道外口為基準，所讀出的數字即為陰莖常態下的長度。再用皮尺在離冠狀緣1厘米的陰莖干部測其周徑。由于病人緊張或不適應診室的環境，他們在醫生面前多不能勃起，故常用陰莖的牽拉長度取代勃起長度。

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