心電圖

在沒有進行心臟超聲檢查條件時，心電圖可提示某些心臟病的特征性改變，如電軸重度左偏提示心內膜墊缺損;電軸左偏并左心室肥大提示三尖瓣閉鎖，或右心室發育不良和肺動脈閉鎖等。

胸部X光片

如果懷疑新生兒存在心臟病，可去拍攝胸部X光片。通常，蛋形心臟提示大動脈轉位，靴形心臟提示法洛四聯癥。

超聲心動圖

包括M型超聲、二維超聲、彩色多普勒超聲，近年發展的三維超聲，這是新生兒期心臟病最有價值的診斷方法。對于新生兒來講，由于顯示的圖像清晰，可對各種心臟、大血管和冠狀動脈畸形均能診斷，并能判斷心功能及肺動脈壓力。而且。這種檢查沒有創傷，容易被家長和患兒接受，還可用來動態觀察心臟變化。

心臟磁共振顯像

這也是一種無創性檢查，主要用于超聲心動圖不能診斷的畸形先心病，如周圍肺動脈畸形和內臟異位等。

心導管和心血管造影術

隨著超聲心動圖的發展，心導管的診斷價值退居次位，主要用于超聲心動圖不能見到的動靜脈旁路、遠端肺動脈發育不良等。但對于復雜的心臟畸形，在手術前還需進行心導管檢查和心血管造影術，進一步明確心臟畸形和各項生理指標。目前，心導管和心血管造影術更多的是用于治療，如新生兒早期房間隔造瘺術和動脈導管堵閉。