胃食管反流病的病因比較復雜，正常人胃內的東西不會進入食道，而出現反流就是其屏障功能出現了問題。屏障位于食管和胃的連接處，相當一個門一樣，如果它的功能正常，胃內的東西就不會進入食道，如果這個門關閉不緊，就會導致胃內的東西進入食道。另外正常人胃內的東西進入食道后，也可以通過吞咽清理到胃內。這就是食道的清酸功能，以保護食道不會受到損害。食道粘膜本身也有保護功能。如果食道的保護功能下降，也會導致胃食管返流。