自閉癥可能是由生理因素形成，如神經機能發展、生化機能發展、遺傳因素或腦部受損所致。 可能導致自閉癥的成因包括遺傳和受疾病感染。

遺傳

從家族和攣生子的研究中，發現自閉癥人士的攣生兄弟姊妹大約有10%至20%可能有輕微的自閉傾向。從家族和攣生子的研究中，發現自閉癥人士的攣生兄弟姊妹大約有10%至20%可能有輕微的自閉傾向。

受疾病感染

婦女懷孕期間可能因德國麻疹或風疹，使胎兒的腦部發育受損而導致自閉癥。婦女懷孕期間可能因德國麻疹或風疹，使胎兒的腦部發育受損而導致自閉癥。 此外，新陳代謝疾病亦會造成腦細胞功能失調，影響腦神經傳遞信息的功能，因而造成自閉癥。此外，新陳代謝疾病亦會造成腦細胞功能失調，影響腦神經傳遞信息的功能，因而造成自閉癥。

還有，在懷孕期間窘迫性流產等因素而造成嬰兒大腦發育不全，早產、難產、新生兒腦部受傷，以及在嬰兒期患上腦炎、腦膜炎等疾病造成腦部傷害，都可能會增加罹患自閉癥的機會。還有，在懷孕期間窘迫性流產等因素而造成嬰兒大腦發育不全，早產、難產、新生兒腦部受傷，以及在嬰兒期患上腦炎、腦膜炎等疾病造成腦部傷害，都可能會增加罹患自閉癥的機會。