貝克的認(rèn)知療法與理性行為療法對事實(shí)的驗(yàn)證都采用高度的結(jié)構(gòu)性，使當(dāng)事人在經(jīng)驗(yàn)層次上能逐漸了解自己對于真實(shí)的情境所做的錯(cuò)誤的解釋。然而，理性行為療法與認(rèn)知療法之間仍有許多重要的差異，特別是在治療方法與治療風(fēng)格方面。正如現(xiàn)在大家所了解的，理性行為療法往往相當(dāng)具有指導(dǎo)性、說理性與面質(zhì)性;相反的，貝克強(qiáng)調(diào)蘇格拉底式的對話，強(qiáng)調(diào)協(xié)助當(dāng)事人自己去發(fā)現(xiàn)錯(cuò)誤觀念，并比理性行為療法更具結(jié)構(gòu)性。

通過這種反映式的詢問過程，貝克致力于與當(dāng)事人建立起合作氣氛，以測試其認(rèn)知的有效性(這一過程貝克稱之為"合作式的經(jīng)驗(yàn)主義")。療效是當(dāng)事人通過收集到矛盾的證據(jù)，進(jìn)而面質(zhì)自己的錯(cuò)誤信念所產(chǎn)生的。

埃利斯則致力于說服當(dāng)事人認(rèn)定自己的某些信念是非理性的;他會(huì)指出這些信念就是發(fā)揮不出功用，并且大部分是通過一種理性的爭論。REBT旨在有意促進(jìn)當(dāng)事人去發(fā)現(xiàn)自己的教條主義與絕對性的思考方式，進(jìn)而有力、重復(fù)地加以減少。

貝克對理性行為治療法的非理性信念的要領(lǐng)有不同的看法，他認(rèn)為告訴當(dāng)事人自己正在做“非理性的思考”可能會(huì)有害，因?yàn)樵S多人相信他們是“根據(jù)真相來了解事情”的(1976，p.246)。他認(rèn)為功能不良的信念之所以有問題，是因?yàn)樗鼈兏蓴_了正常的認(rèn)知過程，而不是因?yàn)樗鼈兪欠抢硇缘?Beck & Weishaar，1995)。他以較正面的角度來看待偏差的信念，相對于REBT認(rèn)為偏差的信念在哲學(xué)上與現(xiàn)實(shí)不相容。(Weishaar，1993)。相反的，貝克強(qiáng)調(diào)，“不正確的結(jié)論”(inaccurate conclusions)比“非理性信念”貼切，因?yàn)槟承┯^念并不是非理性，而是太絕對、太廣義、太極端了。貝克認(rèn)為，人們是遵循“規(guī)則”(即前提假設(shè)或公式)在生活著，他們之所以產(chǎn)生困擾是因?yàn)樗麄兪褂弥�一組不實(shí)際的規(guī)則在貼標(biāo)簽、解釋與評估情境，或者是不適當(dāng)或過度地使用這些規(guī)則。如果當(dāng)事人使用著一組可能使生活不幸的規(guī)則，則治療者會(huì)建議他們考慮改變規(guī)則，而不須去教導(dǎo)、訓(xùn)誨對方，因此認(rèn)知治療往往在開始時(shí)會(huì)先認(rèn)清當(dāng)事人的價(jià)值觀，并在咨詢中持續(xù)地要求對方對自己的信念提出證據(jù)。“你認(rèn)為……的證據(jù)在那里?”是常向?qū)Ψ皆儐柕膯栴}。

認(rèn)知治療法的治療關(guān)系與理性行為治療法最主要的差異之一在于前者強(qiáng)調(diào)治療關(guān)系。如上面所述，艾里斯視治療者扮演教師的角色，不認(rèn)為溫暖的治療關(guān)系是必要的，即使溫暖的關(guān)系可能有其益處;相反的，貝克(1987)強(qiáng)調(diào)治療關(guān)系的品質(zhì)是認(rèn)知治療法的基礎(chǔ)，成功的咨詢要靠治療者某些令人喜愛的人格特點(diǎn)，例如，真誠溫暖、正確的同理心、不批判地接納，以及與當(dāng)事人建立信任與支持的關(guān)系，羅杰斯在個(gè)人中心治療法中所提出的“治療的核心條件”，在認(rèn)知治療法中也視為是必要的，但是若要產(chǎn)生最佳的治療效果，單有這些還是夠的。咨詢員也必須對于認(rèn)知有清楚的要領(lǐng)、積極、有創(chuàng)意、能夠通過蘇格拉底式的對話引導(dǎo)當(dāng)事人，以及擁有足夠的知識(shí)與技能，能使用各種認(rèn)知技術(shù)與行為技術(shù)，引導(dǎo)當(dāng)事人自我發(fā)掘，進(jìn)而產(chǎn)生改變(Weishaar，1993)。咨詢員擔(dān)任催化劑與向?qū)У慕巧�，協(xié)助當(dāng)事人了解其信念與力度會(huì)影響其感受與行為。咨詢員促使當(dāng)事人去體驗(yàn)矯正的經(jīng)驗(yàn)，使對方在認(rèn)知上產(chǎn)生改變，并能學(xué)會(huì)一些新技能(Beck et al，1979;1995Beck & Weishaar，1995)。

治療技術(shù)作用在治療者與當(dāng)事人之間已建立起“治療的合作關(guān)系”時(shí)最為有效。這點(diǎn)與下列的理論假設(shè)是一致的：人們的內(nèi)心溝通可能浮現(xiàn)上來反省：當(dāng)事人的信念對于個(gè)人有重要意義;以及這些意義可以由當(dāng)事人去發(fā)掘，而不是由咨詢員去教導(dǎo)對方或加以解釋(Weishaar，1993)。認(rèn)知治療者會(huì)持續(xù)、主動(dòng)，以及謹(jǐn)慎地與當(dāng)事人接觸，也努力使對方主動(dòng)提出可以驗(yàn)證的假說。貝克認(rèn)為，咨詢過程中合作的伙伴關(guān)系，可以促使當(dāng)事人自己去評估那些富有有個(gè)人意義性的負(fù)面假定，這相對于由咨詢員直接建議當(dāng)事人采納哪些替代認(rèn)知(Beck & Weishaar，1992)。這種作法的假設(shè)是，思考與行為要長期改變，需要配合當(dāng)事人的了解、察覺及努力(Beck et al.，1979;1995Beck & Weishaar，1993)。這使認(rèn)知治療法跟REBT一樣，成為一種整合性的心理治療法。