左金丸的治法是清瀉肝火，和胃降逆止嘔，以黃連為君，可以清胃熱，清肝火，吳茱萸為臣藥，也可以看成是佐使藥，吳茱萸引黃連入肝經，又可疏肝，和胃降逆，吳茱萸辛溫，可使黃連涼而不瘀。

這個方由兩味藥構成。方義分析彼此的關系是重點。黃連擅長于清胃熱，能夠清心火。這里使用也可以照顧到肝郁化火，引起心火。但主要在這里有清胃熱作用。有肝火要清肝，黃連，吳茱萸同用，吳茱萸有引黃連入肝經的作用。大劑量黃連和小劑量吳茱萸相配，吳萸引黃連入肝經清肝火，所以既清胃，又清肝。

吳茱萸在方里，既看成是臣藥，也可以看成是佐使藥。因為從和胃降逆來講，黃連沒這個作用。針對肝胃不和，它起到加強對這個病機的治療，這個兼證，胃氣上逆，起主要治療作用。吳茱萸辛溫，單用黃連過分苦寒，它使它涼而不瘀。又可以看作一個佐藥，佐制藥。它能引領黃連入肝經，又像使藥。再加上吳茱萸能疏肝，所以吳茱萸配在這個方里，和黃連關系，吳茱萸體現了多方面的作用。既能疏肝，這個肝經有熱化火，用苦寒黃連容易涼而使肝氣機郁滯，肝臟喜條達惡抑郁，所以它帶有疏肝特點。同時可以制約黃連過于苦寒，它可以和胃降逆，又可以引經，引領黃連入肝經，所以歷來對吳茱萸分析，大概有這幾個方面。它直接治療作用是降逆止嘔，所以在用量方面，為了保證這個方它是以清肝火為主，所以吳茱萸和黃連的比例是1比6。黃連量大，保證整方是清肝火為主。實際運用當中，這是靈活的。當然用左金丸針對肝火犯胃，黃連量絕對要比吳茱萸多得多。