蒙醫(yī)用藥很廣泛，包括植物、動(dòng)物、礦物及化學(xué)制品，但絕大部分還是取自野生植物。據(jù)文獻(xiàn)記載，蒙藥材約有2230多種。經(jīng)調(diào)查考證的蒙藥材，屬于植物種子、果實(shí)類(lèi)的有203種；根及根莖類(lèi)231種；全草類(lèi)256種；枝葉類(lèi)54種；花類(lèi)83種；皮類(lèi)35種;藤木類(lèi)36種;菌藻類(lèi)14種；樹(shù)脂類(lèi)14種；植物的其他類(lèi)28種;昆蟲(chóng)類(lèi)30種；動(dòng)物類(lèi)260種;礦石類(lèi)98種。共計(jì)1342種。當(dāng)?shù)禺a(chǎn)蒙藥材有：香青蘭、沙前胡、播娘蒿、角茴香、牧馬豆、腺莖獨(dú)行菜、沙棘、蓮座薊、文冠木、杠柳、蒙古山蘿卜花、白龍昌菜、山刺玫、金蓮花、冷蒿、梅花草、花錨、扁蕾、齒葉草、手掌參、蒙古芯芭、火絨草、紫花高、烏頭、唐松草等。據(jù)調(diào)查全區(qū)可資利用的蒙古野生藥材達(dá)800余種。除自產(chǎn)自用當(dāng)?shù)禺a(chǎn)的藥材外,中蒙藥、蒙藏藥也大量交叉應(yīng)用。如肉蓯蓉通用于滋補(bǔ)強(qiáng)壯，而蒙醫(yī)還多用于治療胃病;中蒙藥通用草烏,而蒙醫(yī)不僅用烏頭,還用草烏茸（地上四橫,指嫩苗或加工的草與芽）、草烏葉、草烏花等，且用于濕熱病、半身不遂、五官科疾病等；如訶子中蒙醫(yī)通用，但蒙醫(yī)更為廣泛用于各種疾病；廣棗，中醫(yī)用它的樹(shù)皮治療燙傷，蒙醫(yī)則用其果實(shí)治療心臟病；肉豆蔻，中醫(yī)煨用于暖脾胃，澀湯，下氣，蒙醫(yī)用生肉豆蔻治療心臟病，并用其假種皮“肉豆寇衣”（藥名為玉果花），治療風(fēng)、氣、白脈病。蒙藏藥交叉應(yīng)用更為普遍，如三棵針、山川柳、山刺梨、土木香、小葉蓮、冬青、毛瓣綠絨蒿、雙色龍膽、烏奴龍膽、白花龍膽、石榴、紅景天、纖毛婆婆納、橐吾、傘梗虎耳草、卷絲苦苣苔、波棱瓜子、雪蓮花、船盔烏頭、翼首草、囊距翠雀等。