與西醫(yī)不同的是，中醫(yī)是以整體層次上的證候為對象，以建立在哲學(xué)和系統(tǒng)論原理基礎(chǔ)上的陰陽五行為方法論，所形成的以藏象經(jīng)絡(luò)和病因病機(jī)為核心的基礎(chǔ)理論體系。筆者在《中醫(yī)形上識》中，對中醫(yī)和西醫(yī)生物醫(yī)學(xué)的定義是這樣概括的：中醫(yī)學(xué)是研究證候及其變化規(guī)律而形成的防病治病的科學(xué)體系;如果把研究方法也包含進(jìn)去，中醫(yī)學(xué)則是以陰陽五行學(xué)說的理論、方法研究證候及其變化規(guī)律而形成的防病治病的科學(xué)體系;如果從哲學(xué)和現(xiàn)代系統(tǒng)科學(xué)的角度上說，中醫(yī)學(xué)是以哲學(xué)和系統(tǒng)科學(xué)方法研究整體層次上的機(jī)體反應(yīng)狀態(tài)所形成的防病治病的科學(xué)體系。同書對西醫(yī)生物醫(yī)學(xué)的定義是這樣概括的：以還原性科學(xué)方法，研究人的器官、組織、細(xì)胞、分子層次上的結(jié)構(gòu)與功能，所形成的防病治病的科學(xué)體系。后來在“中西醫(yī)之間的公理性原則和人類醫(yī)學(xué)革命”一文中，又對中醫(yī)的科學(xué)定位補充解釋說：“中醫(yī)是哲學(xué)和系統(tǒng)論原理孕育的醫(yī)學(xué)科學(xué)。”

現(xiàn)存最早的中醫(yī)理論巨著《黃帝內(nèi)經(jīng)》，對其所建立的醫(yī)學(xué)理論體系是充分肯定的。比如，該書在“陰陽應(yīng)象大論”里說：“論理人形，列別藏府，端絡(luò)經(jīng)脈，會通六合，各從其經(jīng);氣穴所發(fā)，各有名處;豀谷屬骨，皆有所起;分部逆從，各有條理;四時陰陽，盡有經(jīng)紀(jì);外內(nèi)之應(yīng)，皆有表里”。

德國漢學(xué)家M·波克特指出：“中醫(yī)是成熟的科學(xué)，而且在兩千多年前就達(dá)到了成熟科學(xué)的水平”。這句話，絲毫沒有錯。否則，經(jīng)無數(shù)醫(yī)學(xué)家之手，歷近千年之努力而形成的《黃帝內(nèi)經(jīng)》，是不會用“各從其經(jīng)”、“各有名處”、“皆有所起”、“各有條理”、“盡有經(jīng)紀(jì)”、“皆有表里”如此堅定、明確的語詞，作自我肯定的�！饵S帝內(nèi)經(jīng)》之后，中醫(yī)兩千多年的實踐也證明了這一點。

這里結(jié)合本文以上各節(jié)的討論，對于中西醫(yī)之間的共同之處與不同之處，再做一些進(jìn)一步的概括。中西醫(yī)之間的共同之處，可以概括為三點：1.中醫(yī)與西醫(yī)皆是科學(xué)，皆有確切、系統(tǒng)的、獨特的研究對象、研究方法和概念(范疇)體系;2.兩者所面對的，皆是人的生命過程中的客觀實在;3.兩者的醫(yī)學(xué)目的(或服務(wù)的對象)皆是人的健康與長壽，這個“人”皆由形上(或原形)、形下(或原質(zhì))兩方面特性相合而成。

中西醫(yī)之間的不同之處，可以概括為五點：

1.就研究對象而言：中醫(yī)研究的客觀實在是“物之事”運動、變化的過程，或者“整體大于部分之和”的整體，故著重于生命過程中整體層次上的機(jī)體反映狀態(tài)。西醫(yī)研究的客觀實在是構(gòu)成人的“物之質(zhì)”的形態(tài)與結(jié)構(gòu)，或者“整體等于部分之和”的各個部分，故著重于生命過程中整體層下的結(jié)構(gòu)及其功能。

2.就研究方向與方法而言：中醫(yī)是朝著形而上的方向進(jìn)行探索，著重運用了系統(tǒng)(綜合)性的研究方法——把“人”視之為因天道生成的“天然之物”，從整體層次上的“物之事”出發(fā)，一步一步地探求其形上性的生成、變化的原理和規(guī)律;西醫(yī)是朝著形而下的方向進(jìn)行探索，著重運用了還原(分析)性的研究方法——把“人”視之為可以主觀地拆開與組合的器具，從整體層次下的“物之質(zhì)”出發(fā)，一層一層地探求其各個細(xì)節(jié)的結(jié)構(gòu)以及功能。

3.就各自理論體系的形成以及概念、語詞的邏輯學(xué)特點而言：中醫(yī)理論體系的形成著重運用了綜合—演繹的邏輯方法，其名詞術(shù)語基本上屬于抽象概念(或類比概念)，以“像什么”來揭示其概念內(nèi)涵;西醫(yī)理論體系的形成著重運用了分析—歸納的邏輯方法，其名詞術(shù)語基本上是具體概念(或?qū)嶓w概念)，以“是什么”來揭示其概念內(nèi)涵。

4.就科學(xué)的一般性分類而言：中醫(yī)屬于哲學(xué)體系之下的醫(yī)學(xué)科學(xué)，或者哲學(xué)與系統(tǒng)論原理孕育下的醫(yī)學(xué)科學(xué);西醫(yī)屬于物理學(xué)、化學(xué)體系之下的醫(yī)學(xué)科學(xué)。

5.就中、西醫(yī)以上四條“不同之處”而言：這兩種醫(yī)學(xué)是科學(xué)范式彼此不同的醫(yī)學(xué)體系，在基礎(chǔ)理論上，彼此是不可通約性的關(guān)系，在醫(yī)療實踐上，彼此是并存、并重，優(yōu)勢互補的關(guān)系;兩者之間絕不是一者輕、一者重，一者古、一者新的關(guān)系，也不是一者落后、一者先進(jìn)，一者科學(xué)、一者不科學(xué)的問題。

以上所講的“中西醫(yī)之間的共同之處”與“不同之處”，當(dāng)屬于從不同角度上對中西醫(yī)科學(xué)定位的總結(jié)和概括。