病因和病理機制尚不明確可能和以下原因有關。
遺傳因素:
口吃患者家族發病率可達36%～55%，故有人認為與遺傳因素有關。可能為單基因遺傳，也有人發現口吃患者及親屬中左利手多見，認為口吃與大腦優勢側有關。
軀體因素:
較多兒童圍產期或嬰幼兒期曾受到有害因素作用，如胎兒期母體患妊娠毒血癥出血或軀體性疾病或發育過程中患某些傳染病使神經系統功能弱化言語功能受累而致口吃。
精神因素:
兒童口吃往往發生在急性或遷延性精神創傷之后，因而不少學說認為精神因素可能為口吃的重要發病原因。
其它因素:
有的學齡前兒童罹患口吃，是因模仿所致。有資料則根據腦電圖發音肌肌電圖和氟哌啶醇臨床療效推斷，口吃可能與邊緣系統和網狀結構復合體活動增強發音肌功能不協調和基底節存在生化障礙等因素有關，但尚待臨床進一步論證。
總之口吃可能是生理與心理多種因素綜合作用的結果。