腦癱的病因是錯綜復雜的，基本可以分為產前、產時和產后以及其他未知因素。但是這些病因的患兒并不一定會發生腦癱，所以只能將這些因素歸類為腦癱的潛在危險因素。
據流行病學調查顯示，70%～80%的腦癱與產前因素有關，母親妊娠期各種異常情況均可視為腦癱的危險因素。宮內感染、多胎妊娠、宮內發育遲緩、孕期母親因素是引起腦癱的重要原因。
宮內感染是引起胎兒神經發育異常的原因，常見的有巨細胞包涵體病毒、弓形蟲、風疹病毒、單純皰疹病毒、EB病毒和梅毒螺旋體等，如巨細胞包涵體病毒感染常伴有腦癱、癲癇、弱智等中樞神經后遺癥，CT表現以顱內鈣化常見，大部分弓形蟲感染的患兒出生時無癥狀，感染數月到數年后才出現異常。在腦癱、癲癇、神經性耳聾患兒中，弓形蟲IgG檢出率顯著增高。
眾所周知，多胎妊娠時早產及低體重兒出生率明顯高于單胎兒，故腦癱發生率也隨之增加。由于多胎妊娠時胎盤功能相對不足，特別是某些雙胎胎盤所特有的病理情況，如胎兒間輸血綜合征，則會出現供血胎兒貧血、低體重，受血胎兒血容量過高、水腫、心力衰竭等。
另外，宮內發育遲緩，或者孕期母親受到了各種危害因素的影響，都會導致大腦的發育受損。頭顱發育障礙會導致小腦畸形，進而制約了腦組織的發育。
